1、基金种类少。场内基金的种类相对场外基金来说更少，且主要是LOF、ETF基金和封闭式基金，投资者的选择面较窄。
2、容易频繁交易。场内基金和股票一样是实时成交的，而且场内基金的手续费较低，规定最高不会超过成交额的千分之三。这样就导致投资者容易在基金价格的波动中频繁操作买卖，追涨杀跌，反而增加了亏损的风险，而且频繁操作累计的手续费也就不少了。
3、无法定投。场内基金无法直接设置定投，基金所有的买卖操作都需要投资者在证券账户上手动操作，这样很可能会遗忘或者错过买基金的时机。
4、需要实时盯盘。场内基金的净值是实时波动的，投资者买入卖出都需要实时盯盘，不然很容易错过买卖时机。
5、投资风险大。场内基金价格的波动除了受基金重仓股波动的影响，还受市场供求关系的影响，因此投资风险相比场外基金更大。
6、流动性风险。场内基金是用户与用户之间买卖基金份额，一买一卖之间都要对接具体的投资订单，如果基金行情不佳，成交量较少，可能会出现投资者卖不出基金份额的情况，这就是基金的流动性风险。
7、溢价风险。很多场内基金也能场外申购，但一般在场外都会限购，这就导致了该基金的场内价格和场外价格不一样，投资者在买卖场内基金时出现溢价买入、折价卖出的情况，增加了投资成本，减少了投资收益。
8、受市场行情影响比较大。场内基金不仅投资标的在二级市场内，其自身也在二级市场内，受到市场行情波动的冲击比场外基金更明显、净值波动也更大。
9、影响基金涨跌的因素比较多。影响场外基金涨跌的因素主要是基金的十大重仓股和基金经理的运营操作，而场内基金除此之外还会受到市场波动、大额买卖资金、基金成交量等的影响。
10、交易较为麻烦。场外基金可以直接在基金代销平台买入卖出。但场内基金只能由投资者在证券账户上操作，而且市场要求买卖平衡，投资者挂单交易需要有相反交易方向的挂单，才能成交，交易比较复杂烦琐，还有交易失败的可能性。