港股通持仓市值对不上可能是由于汇率的影响。投资者在使用港股通交易买入的时候，是把人民币换成了港币。卖出后，有把港币换回人民币，所以持有期间成本价每天都会变。
港股通的参考成本价是以港币计算的，涉及买入时将港币换成人民币，卖出时将人民币换成港币的过程，一买一卖两次换汇。
而买卖参考汇率与买卖结算汇率之间也存在差异，一般来说买卖参考汇率都要比买卖结算汇率多冻结3%的资金。
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