一般办理了公积金对冲是当月生效的，但是如果在办公积金对冲生效前已经还清了当月贷款，虽然已经生效，但也要次月才会正式开始对冲还款。如果当月还未开始还房贷，则到了还款日当天，优先进行公积金对冲，对冲后已经还清了房贷，则系统不会再发起扣款。
公积金对冲还款怎么办理
一、办理住房公积金冲还贷的申请，必须符合以下条件：
1、冲还贷业务办理对象以银行住房公积金借款合同中借款签订人为准。
2、借款人申请冲还贷金额不少于2万元，借款人或配偶住房公积金账户余额不少于申请冲还贷款金额且冲抵后其住房公积金账户余额不少于100元;
3、申请人信誉良好，申请冲还贷时没有逾期情形发生;
二、借款人申请住房公积金冲还贷需提供的材料：
1、银行住房公积金借款合同原件;
2、夫妻双方身份证、结婚证原件及复印件一份;
3、住房公积金专用折;
三、办理流程：
1、借款人持上述材料到住房公积金贷款银行提出申请;
2、银行工作人员根据借款人提供的材料进行审核后受理;
3、借款人当场签订个人贷款提前还款申请书、提取住房公积金冲还贷划款委托书及申请办理住房公积金冲还贷业务须知;(借款人及其配偶住房公积金账户余额不足时，委托还贷协议自动终止)
4、住房公积金贷款银行将相关资料送市公积金中心审核后，符合条件的由市公积金中心出具审核表送缴存银行实施账户扣划。
四、账户划款
1、市公积金中心以冲还贷划款委托书为依据将借款人申请归还的贷款从借款人住房公积金个人账户划至借款人贷款账户，冲抵其住房公积金贷款;
2、贷款银行需于冲还贷资金到账的当天完成还贷手续并将资金划回市公积金中心指定的账户;
3、各承办银行免收资金划转过程中产生的跨行手续费。
五、委托协议终止
1、完成该笔住房公积金冲还贷业务申请;
2、住房公积金个人账户余额不足支付所申请还贷金额的;
3、发生贷款逾期的;
4、住房公积金贷款已还清的;
5、住房公积金个人账户已办理异地转出的;
6、发生其他无法履行冲还贷协议情况的。